3. Bustanuts Tsani
Setingkat Sekolah Menengah Pertama, masa pendidikan 4 tahun
4. Bustanuts Tsalist
Setingkat Sekolah Menengah Atas, masa pendidikan 4 tahun.
5. Isti’dadul lill Maqooshidul Qur’an
Pendidikan Tinggi setara D2. Lembaga ini terdiri dari dua fakultas yaitu fakultas Keguruan dan fakultas Manajemen.
Itulah pendidikan formal yang ada di Pesantren Siddiqiyah Ploso Jombang yang ijin operasionalnya ditutup.***