Jasir Hadibroto tak pernah menceritakan soal kematian DN Aidit setelah berhasil ditangkap pasukan tentara.
Namun sebuah versi menyebutkan bahwa usai ditangkap, sesuai perintah Jenderal Soeharto, Jasir Hadibroto kemudian membawa DN Aidit ke sebuah sumur tua di tengah kebun pisang yang sangat lebat dan jauh dari pemukiman.
Saat akan dibawa ke sumur tua, Jasir Hadibroto mengatakan kepada DN Aidit bahwa dia akan dihukum mati di tempat seperti para jenderal dihukum mati dan mayatnya dibuang ke dalam lubang.
Di dekat sumur tua itu, DN Aidit ditembak mati oleh pasukan tentara dan mayatnya dibuang ke dalam sumur tua tersebut.
Versi lain menyebutkan, setelah ditembak mati, jasad DN Aidit kemudian dibakar dan abunya dibuang ke dalam sumur tua di kebun pisang tersebut.
Kematian DN Aidit dihari itu menandai pelariannya hampir selama 2 bulan setelah rencana mereka melakukan G30S PKI gagal total dan berhasil ditumpas tentara di bawah komando Jenderal Soeharto.***